外泌体蛋白质组学服务
TMT
DIA
4D Label Free
Shotgun
TMT标记定量蛋白组学
TMT (Tandem mass tag)是由ThermoFisher Scientific公司研发的一种多肽体外等重同位素标记的相对与绝对定量技术,采用6、10及16种同位素的标签,通过特异性标记多肽的氨基基团,经高分辨质谱仪串联分析,可同时比较多达16种样品之间的蛋白质表达量,是定量蛋白质组学中经典的高通量筛选技术。
实验流程
数据分析
标准数据分析内容 |
|
蛋白质总鉴定数量分析 |
蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
技术优势
同一批次标记的样本统一处理,减少样本处理及实验误差,实验平行性较高
同一批次标记定量稳定性高
通过分级方法可深度可大大增加蛋白鉴定深度
DIA蛋白质组学
DIA(data-independent acquisition,数据非依赖性采集)技术是近年来发展起来的一种新的质谱技术,属于非标记蛋白质组学方法。采用数据非依赖性扫描模式:将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,然后对每个窗口中的所有离子进行检测、碎裂,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的信息。从而降低样本检测的缺失值,同时提高定量准确性和重复性,实现大样本队列中高稳定,高精准的蛋白质组定量分析。 与DDA技术相比,DIA技术的优势包括:(1)采集所有的离子信息,实现更高的数据覆盖度;(2)减少采集的随机性,实现极高的检测重现性、稳定性;(3)采用碎片离子定量,定量精密度、准确性、线性范围大大提高。基于上述技术优势,DIA技术尤其适用于大规模样本的高度覆盖、稳定和可追溯地分析。
实验流程
数据分析
标准数据分析内容 |
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鉴定结果统计与分析 |
样本蛋白质及肽段鉴定柱状图、PCA分布图、定量差异统计分析 |
生物信息学分析 |
GO及GO富集、KEGG及KEGG富集分析、PPI互作网络与module分析 |
差异上下调蛋白KEGG蝴蝶图、KEGG通路功能归属等 |
技术优势
全扫描模式:数据非依赖性采集模式,大大减少高丰度干扰,全面采集高低丰度信号,数据覆盖度提高近40%
超高重现性、稳定性:大样本鉴定重复率提升近40%,定量精密度提升近1倍
超高定量准确度:定量能力接近金标准SRM/MRM靶向技术
Label free 蛋白质组
Label free是一种不依赖于同位素标记的非标记蛋白组定量技术,通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内标,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
实验流程
数据分析
标准数据分析内容 |
|
蛋白质总鉴定数量分析 |
蛋定与定量结果统计、差异结果统计、火山图、聚类热图 |
差异蛋白质功能分析 |
亚细胞定位、结构域分析、GO功能分析、KEGG通路分析、PPT互作网络分析 |
质量控制分析 |
肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布 |
技术优势
无需昂贵的同位素标记试剂,实验周期短
可用于不同物种间的“有无差异蛋白”比较
克服标记定量技术在样本数量的上限制,灵活方便
TMT、Label Free、DIA如何选择
TMT |
Label Free |
DIA |
|
样本类型 |
不限 |
不限 |
不限 |
样本需求量 |
较少 |
很少 |
很少 |
鉴定数量 |
蛋白质150μg以上 |
蛋白质80μg以上 |
蛋白质80μg以上 |
实验群体较大 |
不能 |
能 |
能 |
珍贵样本 |
混样 |
可以分析,但是不推荐 |
最优选择 |
抢救性数据发掘 |
不建议 |
不建议 |
最优选择 |
样本寄送
1.一般不上门取样,请用快递寄送。生物样本应避免反复冻融,当天或次日可到可用冰袋,否则请用干冰,可混冰袋,干冰若挥发完可继续保持低温。
*下单需要填写物流信息,请在寄出样本后保留物流单号并下单。
2.为保证样本接收无误,可随样本附上您的联系方式和样本数量,谢谢!
3.收样信息如下:
收样地址:上海市奉贤区汇丰西路2082号9幢4楼
收样人:希尔博士
电话:18918495545
*请尽量避免我处周末收件,如不可避免,请提前来电 021-58785545-8808 告知,谢谢!
检测周期
35工作日
报告交付
全款到账后交付所有检测数据;或个人先行交付押金(全部检测费用的100%),则交付所有检测数据,我司对公账户收到全款后将押金原路退回;
*支付宝交付押金时请备注“单位+押金”
下单方式
关注逍鹏微信公众号(xpbiomed)→进入右下角“检测服务”→立即下单 | |
寄送地址:上海市奉贤区汇丰西路2082号9幢4楼; 联系信息:希尔博士,18918495545 |
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产品咨询请联系 | |
Tel:021-58785545-8808 Wechat:xpbiomed-ms |
特别注意事项
1. 下单后可自行查看检测进度(个人中心→我的订单);
2. 本司默认仅寄送发票(检测服务类发票,含6%税费)供委托检测方报销使用,如需其他材料请提前说明,在下单页面的备注栏中填写。否则,涉及二次寄送则一律到付,特此告知。
保密承诺
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客户提供产品的检测信息与数据,履行保密义务,未经客户许可,不得擅自公开发表或使用,不得泄露给第三方。检测产品仅做数据统计用及市场宣传材料用。
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