短串联重复序列 (STR, short tandem repeats)
STR: 短串联重复序列(short tandem repeats,STR)也称微卫星 DNA(microsatellite DNA), 通常是基因组中由1~6个碱基单元组成的一段DNA重复序列,由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富,构成了STR基因座的遗传多态性。一般认为人类基因组平均每15 kb就存在一个STR基因座。
人类基因组DNA中平均每6~10kb就有一个STR位点,其多态性成为法医物证检验个人识别和亲子鉴定的丰富来源。不同人体基因组卫星DNA重复单位的数目是可变的,因此,形成了极其复杂的等位基因片段长度多态性。
纯合子:Homozygote,指同源染色体在同 一基因座上的两个等位基因相同。
杂合子:Heterozygote,指同源染色体在同 一基因座上的两个等位基因不相同。
由于STR具有种类多、分布广泛,突变率低,多态性程度高,等位基因多,鉴别能力强(在每个STR 位点上, 多有几个或几十个等位片段),灵敏度高等特点,广泛应用于遗传制图、法医学鉴定、亲属关系分析(特别是亲子鉴定)、疾病基因定位、物种多态性和遗传病的诊断等诸多领域。
美国FBI利用13个STR基因位点加性染色体位点制作一个“联合DNA索引系统(CODIS)”的全国性DNA数据库,应用到犯罪鉴定与法医学鉴定。
在细胞生物学研究领域,STR分型检测已被ICLAC、ATCC 等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定
细胞STR鉴定正常图谱
如发生细胞交叉污染现象,基因组出现多等位基因。
逍鹏生物DrCell实验室采用细胞鉴定金标准STR法进行细胞鉴定工作。对人源细胞21个基因座进行检测,所选用的基因座不仅包含ATCC、DSMZ和JCRB细胞库中的基因座,更添加12个高度多态性位点,可方便与权威数据库进行比对,具有极高的准确性。
详情查阅:细胞STR鉴定
Ref
1. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup,A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end. Nat Rev Cancer, 2010. 10(6):p. 441-8.
2. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup,A.S.N., Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. 2011,ANSI/ATCC ASN-0002-2011.
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