作一个漂亮的外泌体浓度粒径图的正确方式

Dr.Cell实验室在检测外泌体NTA，

提供NTA检测报告时，

经常会被问到：

你们可以提供文献中的粒径图么？

文献中的粒径图怎么作的？……

今天就和小编一起来Get新技能，

学习怎么用Origin软件绘制出文献中NTA粒径图！

01 获得数据

Dr.Cell实验室检测外泌体NTA会提供完整的数据，每个样本每检测一次，将得到以下5个文件（一个样本将至少检测3次，所以一个样本会有3组如下数据）。

①均视频档：记录颗粒的布朗运动状态

②检测报告：PDF（下文中有详细解读说明）

③原始数据：记录检测过程中仪器的温度、电导率等参数，以及原始数据

④检测说明：记录11个位点的检测情况

⑤原始文件：可通过ZetaView软件打开

02 制图

获得以上5个文件后，我们将用文档③中原始数据进行作图，取“Size Distribution”至 “-1 -1 -1 -1” 之间的数据直接将数据复制至Origin软件工作表中（图1）。

【图1】

图1中C列中“E+6”无意义，直接去掉。选中A与C列，右键点击Plot→Line→Line，得到粒径浓度图（图2）

【图2】

03 调整参数

得到粒径图后，需要调整数据参数，首先要双击粒径图中纵坐标，弹出“Y Axis”框，“Display”选择“Scientific：1E3”（图3）。

【图3】

点击“Scale”，“From”选项可以调整为“0”，也可以不调整。“Increment”调整纵坐标单位刻度，此例中调整为“50000”（图4）。

【图4】

【调整纵坐标后的粒径图】

接下来调整横坐标，双击横坐标刻度数值后，点击“Scale”，“From”选项可以调整为“0”，也可以不调整。“To”选项可以调成“600-1000”，“Increment”调整纵坐标单位刻度，此例中调整为“100”（图5）。

【图5】

【全部调整完后的粒径浓度图 】

04 平滑处理

调整完参数后，得到一个新的粒径图，这只是原始图，仍需要对其进行平滑处理，得到最终想要的结果。

点击菜单栏中“Analysis”，“Signal processing”，“Smooth”，选择“Open Dialog”（图6）。

【图6】

弹出框“Output”选项选择“XY = input XY”, 即在原图上直接调整（图7）。

其中“Points of Window”是调整平滑度的，一般可以不用调整，数字越大越失真。

【图7】

【调整后的粒径图】

继续双击峰图跳出“Plot Details”可调整峰图颜色、线条、宽度等（图8）。

【图8】

全部调整完，就是最终在文献中的出现的粒径图了。

【最终粒径图】

【文献中的粒径图 (ref.1) 】

由于软件用的Origin9存在bug，

坐标轴刻度线未展示。

希尔博士推荐科研小伙伴们可以选择用Origin8 。

Reference

Zhang.S et al . Exosomes derived from human embryonic mesenchymal stem cells promote osteochondral regeneration. Osteoarthritis and Cartilage 2016,11:2135-2140.